微生物实验室始建于2006年,是以工业微生物基本技能训练为主,突出工程应用特色的专业基础实验室。
主要设备有光学显微镜、恒温振荡器、培养箱、蒸汽灭菌锅、超净工作台等。可承担生物工程系微生物学的全部教学任务。主要完成的实验内容有:微生物形态观察、接种与无菌操作技术、微生物的分离和纯化技术、理化性能鉴定技术、菌种选育与保藏技术、微生物检测与计数统计。